FC Heliosel on kokku 23 treeninggruppi. Suurem osa nendest on noortegrupid, millele lisanduvad mehed, naised, ÜKE (üldkehaline) ja väravavahtide treeningud. Treeningud toimuvad Tartu linnas, Kõrvekülas ja Lähtel. Lisaks neile on FC Heliosel ka lasteaiagrupid – kokku 9 lasteaias.
